周末包机开航后，两岸可望于奥运后就货运包机、增加包机航班、直航航路等议题进行协商，最快可于10月执行，其中大陆可望依两会包机会谈纪要，再增加六个航点，让深圳航空有限责任公司（Shenzhen Airlines Ltd.，简称“深航”）、四川航空股份有限公司（Sichuan Airlines Co.，Ltd.）也飞行两岸包机，使得经营两岸航线的航空公司多达13家。
“台湾交通部”官员表示，“交通部”早已完成三项空运议题规划方案，并提报“行政院大陆委员会”，只要“两会”敲定谈判时间，就可展开协商，大陆之前承诺会再开放成都、重庆、杭州、大连、桂林、深圳等六个航点，将会与增加包机航班一并处理。
在货运包机与直航航路方面，官员强调，这两项议题会一并讨论，因为如果货运包机不直航，开通货运包机的意义不大；而直航航路一确定，客、货运包机都可以走，对航空公司与旅客而言将可节省大量油料与飞航时间。
据了解，台湾方面规划的直航北航路，走现在的国际航路B576，闪过日本琉球飞行情报区后，西转进入上海飞行情报区，前往华中、华北的航点，接现在的大陆国内线；南航路则循现在的A1航路到香港后，穿越广州到华南和西南。
官员表示，新航路划定后必须向国际民航组织（ICAO）申请，并公告国际，以免其他航线的飞机误闯，作业时间约42天，因此，如果奥运结束后两岸展开会谈，且一切顺利的话，最快10月中旬两岸包机就可走直航航路。
两岸对新航路已初步交换过意见，还须双方的航管单位就空域权责、航路设置、航管作业、飞行资料交换，以及航空器失事救助等技术性事项，先行讨论。
官员说，两岸两会包机会谈纪要中限制飞行的班次，但未规定飞行的业者家数，而新增的六个航点中，成都、重庆主要由川航经营；深圳为深航的总部，基于照顾地方业者利益，大陆应会开放这两家航空公司也加入两岸包机营运行列。
官员指出，不管大陆是否新增航空公司加入两岸包机飞行，只要市场需求持续增加，目前的18班绝对不能满足使用，至于会增加多少班次，双方会就市场状况进行协商。
